Santiago de Chile, 25 de julio de 2024 — La Organización Panamericana de la Salud (OPS) inició el 22 de julio el primer Taller Subregional de Secuenciación Genómica y Análisis Bioinformático para el Virus del Dengue. Este evento, que se llevó a cabo del 22 al 26 de julio de 2024 en el Instituto de Salud Pública de Chile, reunió a expertos de la región sudamericana para fortalecer las prácticas de bioinformática y vigilancia genómica.
El taller fue parte de la RED ViGenDA (Vigilancia Genómica de Arbovirus de las Américas), una iniciativa lanzada en 2014 en colaboración con los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) y la Red de Laboratorios de Arbovirus de las Américas (RELDA). Desde 2018, ViGenDA, que comenzó como un proyecto para la secuenciación del dengue, amplió su enfoque para incluir la vigilancia genómica de otros arbovirus como Chikungunya, Zika, y recientemente, las encefalitis equinas y el virus oropouche, en respuesta a un panorama epidemiológico en evolución.
Actualmente, ViGenDA es parte de PAHOGen, la red regional de vigilancia genómica de la OPS que agrupa varias redes e iniciativas regionales de vigilancia genómica de patógenos de la OPS.
El principal objetivo del taller fue revisar y actualizar las metodologías de laboratorio para el procesamiento de muestras, la construcción de bibliotecas genómicas y la secuenciación de nueva generación del virus del dengue. Además, se capacitó a los participantes en el análisis de datos de secuenciación, facilitando la extracción de secuencias finales e información filogenética, como genotipos y linajes. También se discutieron plataformas de análisis personalizadas y pipelines bioinformáticos, integrando estos datos en la vigilancia epidemiológica de arbovirus para fortalecer la respuesta regional ante posibles brotes.
La agenda del taller incluyó una combinación de sesiones teóricas y prácticas de análisis in silico de secuencias del virus dengue. Las actividades continuaron durante toda la semana, abordando el manejo de datos, el ensamblaje de genomas y la inferencia filogenética.
La Directora del Instituto de Salud Pública, Catterina Ferreccio, destacó la importancia de unificar el uso de herramientas y compartir experiencias con los países de la región para fortalecer las capacidades locales ante el avance de la propagación del mosquito y la posible introducción de arbovirus en Chile.
Este taller respondió a la necesidad de mejorar la capacidad de monitoreo y respuesta ante la introducción de nuevos genotipos y linajes de dengue en la región. La integración de datos genómicos en los sistemas de vigilancia fue fundamental para la detección y caracterización temprana de patógenos emergentes, fortaleciendo así la preparación y respuesta en salud pública, como se establece en el documento aprobado por los ministros de salud de las Américas en la CSP30/12: "Estrategia de Vigilancia Genómica Regional para la Preparación y Respuesta a Epidemias y Pandemias".
